计算分子动力学模拟中,1个标准大气压下水的分子数密度约为3.34×102? m?3 🆔 ID: 101696 ✅ 可用
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推导典型分子动力学模拟的时间步长在飞秒量级,约1 - 10 fs 🆔 ID: 101697 ✅ 可用
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模拟Lennard - Jones势函数中,σ参数表示分子间势能为零时的分子间距,约为3.4 ?(对于氩气) 🆔 ID: 101698 ✅ 可用
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计算Lennard - Jones势函数中,ε参数表示势阱深度,对于氩气约为0.0103 eV 🆔 ID: 101699 ✅ 可用
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推导在分子动力学模拟中,温度与分子平均动能相关,公式为E = 3/2kT,k为玻尔兹曼常数 🆔 ID: 101700 ✅ 可用
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计算对于氮气分子,在300 K时平均平动动能约为6.21×10?21 J 🆔 ID: 101701 ✅ 可用
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模拟理想气体分子间无相互作用,其势能函数为零 🆔 ID: 101702 ✅ 可用
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推导在分子动力学模拟中,压力可通过维里定理计算,与分子间相互作用和动能有关 🆔 ID: 101703 ✅ 可用
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计算对于简单立方晶体结构的固体,其配位数通常为6 🆔 ID: 101704 ✅ 可用
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模拟分子动力学模拟中,常用的系综有NVE(微正则系综)、NVT(正则系综)和NPT(等温等压系综) 🆔 ID: 101705 ✅ 可用
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推导在NVT系综中,通过恒温器(如Nosé - Hoover恒温器)控制体系温度 🆔 ID: 101706 ✅ 可用
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计算Nosé - Hoover恒温器的参数Q与体系的惯量有关,典型值在10 - 1000原子质量单位×(飞秒)2量级 🆔 ID: 101707 ✅ 可用
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模拟分子间范德华力在短程表现为排斥力,长程表现为吸引力 🆔 ID: 101708 ✅ 可用
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推导范德华力在分子间距离r较大时,按1/r?规律衰减(伦敦色散力部分) 🆔 ID: 101709 ✅ 可用
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计算对于水分子,氢键键长约为0.28 nm,键能约为20 kJ/mol 🆔 ID: 101710 ✅ 可用
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推导在分子动力学模拟中,分子的运动可通过牛顿第二定律F = ma求解 🆔 ID: 101711 ✅ 可用
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计算对于质量为m的分子,在力F作用下,加速度a = F/m 🆔 ID: 101712 ✅ 可用
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模拟分子动力学模拟中,体系的势能包括键伸缩能、键角弯曲能、二面角扭转能和范德华能等 🆔 ID: 101713 ✅ 可用
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推导键伸缩能通常用谐振子势能函数描述,公式为E = 1/2k(r - r?)2,k为力常数,r?为平衡键长 🆔 ID: 101714 ✅ 可用
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计算对于碳 - 碳单键,力常数k约为440 N/m,平衡键长r?约为0.154 nm 🆔 ID: 101715 ✅ 可用
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模拟分子动力学模拟中,可采用周期性边界条件来减少边界效应 🆔 ID: 101716 ✅ 可用
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推导周期性边界条件下,分子在模拟盒子边缘离开时,会从对面边缘重新进入 🆔 ID: 101717 ✅ 可用
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计算在分子动力学模拟中,扩散系数D与均方位移MSD的关系为D = lim(t→∞)MSD/(6t) 🆔 ID: 101718 ✅ 可用
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模拟对于小分子液体,在室温下扩散系数通常在10?? - 10?1? m2/s量级 🆔 ID: 101719 ✅ 可用
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推导在分子动力学模拟中,体系的能量守恒是验证模拟正确性的重要指标之一 🆔 ID: 101720 ✅ 可用
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计算在NVE系综中,体系总能量(动能 + 势能)应保持恒定,波动范围通常在1%以内 🆔 ID: 101721 ✅ 可用
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模拟分子动力学模拟中,可采用速度 - Verlet算法来积分运动方程 🆔 ID: 101722 ✅ 可用
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推导速度 - Verlet算法的时间步长更新公式为r(t + Δt)=r(t)+v(t)Δt + 1/2a(t)(Δt)2,v(t + Δt)=v(t)+1/2[a(t)+a(t + Δt)]Δt 🆔 ID: 101723 ✅ 可用
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计算在分子动力学模拟中,径向分布函数g(r)可描述体系中分子的分布情况 🆔 ID: 101724 ✅ 可用
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推导g(r)在r较小时趋近于0,随着r增大先上升到峰值,然后逐渐趋于1(与理想气体情况相似) 🆔 ID: 101725 ✅ 可用
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