计算蛋白质磷酸化修饰位点（如Ser/Thr/Tyr）的激酶（Kinase）催化效率与底物序列保守性（Conservation Index）的函数关系 🆔 ID: 161244 ✅ 可用
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模拟蛋白质乙酰化修饰（Acetylation）对组蛋白（Histone）DNA结合能力的影响与赖氨酸（Lysine）残基ε-氨基化学环境（pKa偏移）的关联模型 🆔 ID: 161245 ✅ 可用
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分析蛋白质泛素化修饰（Ubiquitination）过程中E3泛素连接酶（E3 Ligase）识别底物蛋白（Substrate Protein）的特异性与泛素（Ubiquitin）分子对接构象（Docking Conformation）的统计相关性 🆔 ID: 161246 ✅ 可用
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建立蛋白质甲基化修饰（Methylation）位点（如Arg/Lys）的甲基转移酶（Methyltransferase）活性与底物氨基酸侧链（Side Chain）空间位阻（Steric Hindrance）的约束方程 🆔 ID: 161247 ✅ 可用
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量化蛋白质糖基化修饰（Glycosylation）中糖链（Glycan）结构（如N-糖链、O-糖链）与蛋白质翻译后转运（Trafficking）途径（如内质网-高尔基体途径）的对应关系 🆔 ID: 161248 ✅ 可用
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模拟蛋白质羟基化修饰（Hydroxylation）对胶原蛋白（Collagen）三股螺旋（Triple Helix）结构稳定性（Thermal Stability）的分子动力学（MD）模拟结果 🆔 ID: 161249 ✅ 可用
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计算蛋白质棕榈酰化修饰（Palmitoylation）对膜蛋白（Membrane Protein）跨膜定位（Transmembrane Localization）与脂筏（Lipid Raft）微环境（Microenvironment）的关联参数 🆔 ID: 161250 ✅ 可用
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分析蛋白质SUMO化修饰（SUMOylation）过程中SUMO蛋白（Small Ubiquitin-like Modifier）与靶蛋白（Target Protein）相互作用界面（Interaction Interface）的静电势能（ESP）分布 🆔 ID: 161251 ✅ 可用
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建立蛋白质硝基化修饰（Nitration）对酪氨酸（Tyrosine）残基活性（Reactivity）影响与一氧化氮（NO）浓度（Concentration）的剂量 - 反应（Dose - Response）模型 🆔 ID: 161252 ✅ 可用
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量化蛋白质ADP - 核糖基化修饰（ADP - Ribosylation）中NAD?（Nicotinamide Adenine Dinucleotide）分子与靶蛋白（Target Protein）结合亲和力（Binding Affinity）与酶（Enzyme）催化速率（Catalytic Rate）的关系 🆔 ID: 161253 ✅ 可用
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模拟蛋白质豆蔻酰化修饰（Myristoylation）对蛋白质（Protein）N - 末端（N - Terminal）与细胞膜（Cell Membrane）锚定（Anchoring）的分子模拟（Molecular Simulation）结果 🆔 ID: 161254 ✅ 可用
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分析蛋白质异戊二烯化修饰（Prenylation）中法尼基（Farnesyl）/牻牛儿基（Geranylgeranyl）基团与蛋白质（Protein）C - 末端（C - Terminal）CAAX基序（Motif）的结合特异性（Specificity） 🆔 ID: 161255 ✅ 可用
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建立蛋白质硫酸化修饰（Sulfation）中酪氨酸（Tyrosine）残基与硫酸基团（Sulfate Group）结合的化学计量比（Stoichiometry）与酶（Enzyme）活性（Activity）的函数关系 🆔 ID: 161256 ✅ 可用
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量化蛋白质谷胱甘肽化修饰（Glutathionylation）对蛋白质（Protein）活性（Activity）调节（Regulation）与氧化还原状态（Redox State）的动态响应（Dynamic Response）模型 🆔 ID: 161257 ✅ 可用
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模拟蛋白质亚硝基化修饰（Nitrosylation）对半胱氨酸（Cysteine）残基巯基（Sulfhydryl Group）氧化（Oxidation）状态（State）的电子顺磁共振（EPR）检测（Detection）结果 🆔 ID: 161258 ✅ 可用
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分析蛋白质羧基化修饰（Carboxylation）中谷氨酸（Glutamate）残基与二氧化碳（CO?）结合的酶（Enzyme）催化机制（Mechanism）与动力学（Kinetics）参数 🆔 ID: 161259 ✅ 可用
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建立蛋白质磷酸化（Phosphorylation）、乙酰化（Acetylation）等多重修饰（Multiple Modifications）对蛋白质（Protein）功能（Function）协同（Synergistic）或拮抗（Antagonistic）作用的统计模型 🆔 ID: 161260 ✅ 可用
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量化蛋白质糖基化（Glycosylation）修饰异常（Abnormality）与疾病（如癌症（Cancer）、糖尿病（Diabetes））发生（Occurrence）的关联强度（Association Strength）与生物标志物（Biomarker）特性（Characteristics） 🆔 ID: 161261 ✅ 可用
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模拟蛋白质泛素化（Ubiquitination） - 蛋白酶体（Proteasome）途径（Pathway）中泛素链（Ubiquitin Chain）类型（如K48 - 连接（K48 - linked）、K63 - 连接（K63 - linked））与底物蛋白（Substrate Protein）降解（Degradation）速率（Rate）的函数关系 🆔 ID: 161262 ✅ 可用
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分析蛋白质甲基化（Methylation）修饰对染色质（Chromatin）结构（Structure）重塑（Remodeling）与基因表达（Gene Expression）调控（Regulation）的表观遗传学（Epigenetics）机制（Mechanism） 🆔 ID: 161263 ✅ 可用
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建立蛋白质琥珀酰化修饰（Succinylation）中琥珀酰辅酶A（Succinyl - CoA）与赖氨酸（Lysine）残基结合的化学平衡（Chemical Equilibrium）与热力学（Thermodynamics）参数 🆔 ID: 161264 ✅ 可用
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量化蛋白质丙二酰化修饰（Malonylation）对线粒体（Mitochondria）代谢（Metabolism）酶（Enzyme）活性（Activity）调节（Regulation）与能量（Energy）稳态（Homeostasis）的关联模型 🆔 ID: 161265 ✅ 可用
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模拟蛋白质巴豆酰化修饰（Crotonylation）对组蛋白（Histone）染色质（Chromatin）可及性（Accessibility）与转录（Transcription）激活（Activation）的分子机制（Molecular Mechanism） 🆔 ID: 161266 ✅ 可用
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分析蛋白质羟基丁酰化修饰（Hydroxybutyrylation）对代谢（Metabolism）应激（Stress）条件下蛋白质（Protein）功能（Function）调节（Regulation）的适应性（Adaptability）特征（Features） 🆔 ID: 161267 ✅ 可用
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建立蛋白质磷酸化（Phosphorylation）修饰动力学（Kinetics）与信号转导（Signal Transduction）通路（如MAPK通路（MAPK Pathway）、PI3K/AKT通路（PI3K/AKT Pathway））中激酶（Kinase）、磷酸酶（Phosphatase）活性（Activity）的耦合模型 🆔 ID: 161268 ✅ 可用
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量化蛋白质乙酰化（Acetylation）修饰对线粒体（Mitochondria）动力学（Dynamics）（如融合（Fusion）、分裂（Fission））与细胞凋亡（Apoptosis）调控（Regulation）的线粒体功能（Mitochondrial Function）参数 🆔 ID: 161269 ✅ 可用
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模拟蛋白质泛素化（Ubiquitination）修饰对蛋白质（Protein）相互作用（Interaction）网络（Network）重构（Restructuring）与细胞信号传导（Cell Signaling）干扰（Interference）的系统生物学（Systems Biology）分析 🆔 ID: 161270 ✅ 可用
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分析蛋白质甲基化（Methylation）修饰对神经递质（Neurotransmitter）受体（Receptor）功能（Function）调节（Regulation）与神经系统（Nervous System）疾病（如阿尔茨海默病（Alzheimer's Disease）、帕金森病（Parkinson's Disease））关联（Association）的分子基础（Molecular Basis） 🆔 ID: 161271 ✅ 可用
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建立蛋白质糖基化（Glycosylation）修饰对免疫球蛋白（Immunoglobulin）抗体（Antibody）亲和力（Affinity）成熟（Maturation）与免疫应答（Immune Response）调节（Regulation）的免疫学（Immunology）模型 🆔 ID: 161272 ✅ 可用
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模拟蛋白质棕榈酰化（Palmitoylation）修饰对小窝蛋白（Caveolin）介导的内吞作用（Endocytosis）与细胞膜运输（Membrane Transport）的分子机制（Molecular Mechanism） 🆔 ID: 161273 ✅ 可用
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