计算DNA双螺旋结构中碱基对（A-T、G-C）的堆积能（Stacking Energy）与螺旋参数（如螺距、碱基倾角）的函数关系 🆔 ID: 161415 ✅ 可用
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模拟RNA二级结构中茎环结构（Stem-Loop）的形成自由能（ΔG）与序列保守性（Sequence Conservation）的统计相关性 🆔 ID: 161416 ✅ 可用
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分析DNA甲基化（如5-甲基胞嘧啶）对基因表达调控（如启动子区域）的染色质可及性（Chromatin Accessibility）与组蛋白修饰（如H3K27me3）的协同效应模型 🆔 ID: 161417 ✅ 可用
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建立DNA损伤修复（如核苷酸切除修复NER）过程中DNA聚合酶（如Pol δ/ε）的保真度（Fidelity）与错配碱基（Mismatched Base）的识别动力学参数 🆔 ID: 161418 ✅ 可用
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量化RNA剪接（Splicing）过程中剪接体（Spliceosome）核心组分（如U1、U2、U5 snRNP）的组装动力学与pre-mRNA剪接位点（5'剪接位点、3'剪接位点）的互补配对能 🆔 ID: 161419 ✅ 可用
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模拟DNA超螺旋（Supercoiling）状态（如正超螺旋、负超螺旋）对转录起始（Transcription Initiation）中RNA聚合酶（RNAP）结合效率（Binding Efficiency）的拓扑学约束模型 🆔 ID: 161420 ✅ 可用
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计算RNA编辑（Editing）过程中ADAR酶（Adenosine Deaminase Acting on RNA）对腺苷（A）到肌苷（I）的修饰效率与底物RNA二级结构（如发夹结构）的关联函数 🆔 ID: 161421 ✅ 可用
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分析DNA复制（Replication）过程中引发酶（Primase）合成的RNA引物（Primer）长度（如10-12 nt）与DNA聚合酶延伸速率（Extension Rate）的协同关系 🆔 ID: 161422 ✅ 可用
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建立RNA干扰（RNAi）机制中siRNA（Small Interfering RNA）与靶mRNA的完全互补配对（Perfect Complementarity）与沉默效率（Silencing Efficiency）的剂量-反应模型 🆔 ID: 161423 ✅ 可用
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量化DNA甲基化转移酶（DNMT）催化活性（如S-腺苷甲硫氨酸依赖性）与CpG岛（CpG Island）甲基化模式（如全甲基化、半甲基化）的统计学关联 🆔 ID: 161424 ✅ 可用
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模拟RNA转运（Nuclear Export）过程中核孔复合体（NPC）对mRNA-蛋白质复合物（如TREX复合体）的识别效率与mRNA 5'帽子结构（5' Cap）的修饰状态 🆔 ID: 161425 ✅ 可用
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计算DNA重组（Recombination）过程中同源重组（HR）与非同源末端连接（NHEJ）的修复效率（Repair Efficiency）与DNA双链断裂（DSB）末端序列相似性（Sequence Similarity）的函数关系 🆔 ID: 161426 ✅ 可用
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分析RNA稳定性（Stability）中poly(A)尾长度（如30-100 nt）与脱腺苷化酶（PAN2-PAN3、CCR4-NOT复合体）活性的动力学参数 🆔 ID: 161427 ✅ 可用
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建立DNA转座（Transposition）过程中转座酶（Transposase）对靶DNA位点（如TA重复序列）的切割-粘贴（Cut-and-Paste）机制与转座子（Transposon）拷贝数变化的关联模型 🆔 ID: 161428 ✅ 可用
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量化RNA翻译（Translation）过程中核糖体（Ribosome）对起始密码子（AUG）的识别效率（Recognition Efficiency）与mRNA二级结构（如SD序列）的互补配对能 🆔 ID: 161429 ✅ 可用
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模拟DNA表观遗传学（Epigenetics）中组蛋白乙酰化（如H3K9ac、H4K16ac）与DNA甲基化的协同调控（Synergistic Regulation）与基因沉默（Gene Silencing）的染色质重塑模型 🆔 ID: 161430 ✅ 可用
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计算RNA剪接调控（Splicing Regulation）中剪接增强子（ESE）或沉默子（ESS）序列与SR蛋白（如SRSF1）结合亲和力（Binding Affinity）的统计力学参数 🆔 ID: 161431 ✅ 可用
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分析DNA修复（Repair）过程中碱基切除修复（BER）中DNA糖基化酶（如UNG、OGG1）对损伤碱基（如尿嘧啶、8-氧代鸟嘌呤）的识别特异性（Specificity）与催化效率 🆔 ID: 161432 ✅ 可用
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建立RNA病毒（如流感病毒、冠状病毒）基因组RNA复制（Replication）过程中RNA依赖的RNA聚合酶（RdRp）的保真度（Fidelity）与突变率（Mutation Rate）的关联模型 🆔 ID: 161433 ✅ 可用
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量化DNA指纹技术（如STR分析）中短串联重复序列（STR）的扩增效率（Amplification Efficiency）与PCR引物（Primers）设计的Tm值（熔解温度）函数关系 🆔 ID: 161434 ✅ 可用
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模拟RNA加工（Processing）过程中5'端加帽（Capping）酶（如CEG1、RNGTT）对mRNA 5'端三磷酸基团（5' PPP）的催化效率与帽子结构稳定性（Stability）的关联 🆔 ID: 161435 ✅ 可用
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计算DNA测序技术（如NGS）中高通量测序（High-Throughput Sequencing）的读长（Read Length）与DNA片段化（Fragmentation）策略（如超声破碎、酶切）的优化模型 🆔 ID: 161436 ✅ 可用
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分析RNA转运调控（Transport Regulation）中核质转运信号（如NXF1-NXT1复合体）与mRNA核定位信号（如TAP/NXF1结合位点）的相互作用动力学 🆔 ID: 161437 ✅ 可用
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建立DNA甲基化时钟（Epigenetic Clock）中CpG位点甲基化水平（Methylation Level）与生物年龄（Biological Age）的线性回归模型 🆔 ID: 161438 ✅ 可用
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量化RNA剪接异构体（Isoforms）的差异表达（Differential Expression）与组织特异性（Tissue Specificity）的转录组学（Transcriptomics）关联参数 🆔 ID: 161439 ✅ 可用
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模拟DNA复制起始（Initiation）过程中ORC复合体（Origin Recognition Complex）对复制起点（Origin of Replication）的识别效率（Recognition Efficiency）与染色质状态（Chromatin State）的关联 🆔 ID: 161440 ✅ 可用
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计算RNA编辑调控（Editing Regulation）中p53蛋白对ADAR酶活性的转录调控（Transcriptional Regulation）与RNA编辑位点（如GluA2 Q/R位点）的选择性 🆔 ID: 161441 ✅ 可用
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分析DNA损伤应答（DDR）过程中p53蛋白对细胞周期检查点（如G1/S、G2/M）的调控（Regulation）与DNA修复基因（如p21、BRCA1）表达的信号通路模型 🆔 ID: 161442 ✅ 可用
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建立RNA干扰效率（RNAi Efficiency）中siRNA双链体的热稳定性（Thermal Stability）与RISC复合体（RNA-Induced Silencing Complex）装载效率（Loading Efficiency）的关联函数 🆔 ID: 161443 ✅ 可用
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量化DNA重组酶（如RecA）介导的同源重组（Homologous Recombination）过程中单链DNA侵入（Strand Invasion）的效率与同源序列长度（Homology Length）的函数关系 🆔 ID: 161444 ✅ 可用
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