计算pre - mRNA中5'剪接位点(5' splice site)、3'剪接位点(3' splice site)和分支点序列(branch point sequence)的保守性(conservation)与剪接体(spliceosome)识别效率(recognition efficiency)的函数关系 🆔 ID: 161737 ✅ 可用

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模拟U1 snRNP(U1 small nuclear ribonucleoprotein)对pre - mRNA 5'剪接位点的识别过程(recognition process),分析其识别亲和力(recognition affinity)与5'剪接位点序列特征(sequence features)的关联模型 🆔 ID: 161738 ✅ 可用

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分析U2 snRNP(U2 small nuclear ribonucleoprotein)与分支点序列的相互作用(interaction),计算其结合稳定性(binding stability)与分支点腺苷(branch point adenosine)化学环境(chemical environment)的参数 🆔 ID: 161739 ✅ 可用

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建立剪接体(spliceosome)组装过程(assembly process)中U1、U2、U4/U6、U5 snRNP(small nuclear ribonucleoproteins)的动态组装动力学(dynamic assembly kinetics)与pre - mRNA二级结构(secondary structure)的关联模型 🆔 ID: 161740 ✅ 可用

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量化剪接体(spliceosome)催化的两步转酯反应(two - step transesterification reactions)效率(efficiency)与pre - mRNA中内含子(intron)和外显子(exon)长度(length)的函数关系 🆔 ID: 161741 ✅ 可用

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模拟SR蛋白(serine/arginine - rich proteins,如SRSF1、SRSF2)对剪接增强子(exonic splicing enhancers,ESEs)的识别(recognition),计算其结合亲和力(binding affinity)与ESEs序列保守性(sequence conservation)的关联参数 🆔 ID: 161742 ✅ 可用

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分析hnRNP蛋白(heterogeneous nuclear ribonucleoproteins,如hnRNP A1)对剪接沉默子(exonic splicing silencers,ESSs)的结合(binding),量化其抑制剪接(splicing inhibition)作用与ESSs序列特征的关联模型 🆔 ID: 161743 ✅ 可用

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建立剪接位点选择(splice site selection)过程中5'剪接位点和3'剪接位点的竞争(competition)机制(mechanism)与pre - mRNA序列中潜在剪接位点(potential splice sites)分布(distribution)的关联模型 🆔 ID: 161744 ✅ 可用

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计算剪接体(spliceosome)对pre - mRNA的剪接效率(splicing efficiency)与pre - mRNA的甲基化状态(methylation state)(如m?A修饰)的关联模型 🆔 ID: 161745 ✅ 可用

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模拟剪接体(spliceosome)催化反应(catalytic reaction)过程中分支点腺苷(branch point adenosine)的亲核攻击(nucleophilic attack)效率(efficiency)与分支点序列周围碱基(base)的化学环境(chemical environment)的关联参数 🆔 ID: 161746 ✅ 可用

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分析pre - mRNA的二级结构(secondary structure)(如茎环结构stem - loop)对剪接体(spliceosome)组装(assembly)和剪接效率(splicing efficiency)的影响(impact),建立其结构特征(structural features)与剪接过程(splicing process)的关联模型 🆔 ID: 161747 ✅ 可用

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建立剪接异构体(splice isoforms)的产生(generation)与pre - mRNA中可变剪接位点(alternative splice sites)选择(selection)的关联模型,量化不同剪接异构体(splice isoforms)的表达水平(expression level)与组织特异性(tissue specificity)的关联参数 🆔 ID: 161748 ✅ 可用

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模拟剪接调控(splicing regulation)过程中反式作用因子(trans - acting factors,如SR蛋白和hnRNP蛋白)与顺式作用元件(cis - acting elements,如ESEs和ESSs)的相互作用(interaction),计算其对剪接效率(splicing efficiency)的调控效应(regulatory effect)的关联模型 🆔 ID: 161749 ✅ 可用

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分析pre - mRNA的poly(A)尾(poly(A) tail)长度(length)对剪接体(spliceosome)识别(recognition)和剪接效率(splicing efficiency)的影响(impact),建立其长度特征(length features)与剪接过程(splicing process)的关联模型 🆔 ID: 161750 ✅ 可用

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建立剪接体(spliceosome)组装(assembly)过程中U4/U6 snRNP的解离(dissociation)和U6 snRNP与5'剪接位点的结合(binding)动力学(kinetics)与pre - mRNA序列特征的关联模型 🆔 ID: 161751 ✅ 可用

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计算剪接体(spliceosome)催化的剪接反应(splicing reaction)中内含子(intron)的切除效率(excision efficiency)与内含子(intron)长度(length)和分支点序列(branch point sequence)位置的关联模型 🆔 ID: 161752 ✅ 可用

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模拟剪接增强子(exonic splicing enhancers,ESEs)和剪接沉默子(exonic splicing silencers,ESSs)在pre - mRNA中的分布(distribution)对剪接异构体(splice isoforms)产生的影响(impact),量化其分布特征(distribution features)与不同剪接异构体(splice isoforms)比例(proportion)的关联参数 🆔 ID: 161753 ✅ 可用

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217 字 评分 4.8 支持合成 AI指令
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分析pre - mRNA的剪接位点(splice sites)周围序列(surrounding sequences)的保守性(conservation)对剪接体(spliceosome)识别(recognition)的特异性(specificity)的影响(impact),建立其保守性特征(conservation features)与剪接效率(splicing efficiency)的关联模型 🆔 ID: 161754 ✅ 可用

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建立剪接体(spliceosome)动态组装(dynamic assembly)和拆卸(disassembly)过程(process)与pre - mRNA剪接效率(splicing efficiency)的关联模型,量化其组装和拆卸动力学参数(kinetic parameters)与剪接过程(splicing process)的关联参数 🆔 ID: 161755 ✅ 可用

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计算pre - mRNA中可变剪接(alternative splicing)的发生(occurrence)与细胞信号通路(cell signaling pathways)(如MAPK通路、PI3K/AKT通路)调控(regulation)的关联模型,量化信号分子(signaling molecules)对剪接异构体(splice isoforms)表达(expression)的调控效应(regulatory effect)的关联参数 🆔 ID: 161756 ✅ 可用

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219 字 评分 4.8 支持合成 AI指令
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模拟剪接体(spliceosome)对pre - mRNA的识别(recognition)过程中,pre - mRNA的折叠状态(folding state)对剪接位点(splice sites)可及性(accessibility)的影响(impact),建立其折叠特征(folding features)与剪接效率(splicing efficiency)的关联模型 🆔 ID: 161757 ✅ 可用

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184 字 评分 4.8 支持合成 AI指令
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分析pre - mRNA中内含子(intron)和 外显子(exon)的边界序列(boundary sequences)的化学修饰(chemical modifications)(如m?A、m?C)对剪接体(spliceosome)识别(recognition)和剪接效率(splicing efficiency)的影响(impact),量化其修饰特征(modification features)与剪接过程(splicing process)的关联参数 🆔 ID: 161758 ✅ 可用

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建立剪接异构体(splice isoforms)的功能(function)与pre - mRNA中不同剪接位点(splice sites)选择(selection)产生的mRNA结构和编码信息(coding information)变化的关联模型,量化其结构特征(structural features)和编码信息变化(coding information changes)与蛋白质功能(protein function)的关联参数 🆔 ID: 161759 ✅ 可用

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模拟剪接调控(splicing regulation)过程中microRNA(miRNA)对剪接体(spliceosome)组装(assembly)和剪接效率(splicing efficiency)的间接调控(indirect regulation),计算其对剪接异构体(splice isoforms)表达(expression)的调控效应(regulatory effect)的关联模型 🆔 ID: 161760 ✅ 可用

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分析pre - mRNA的剪接位点(splice sites)的序列特征(sequence features)(如GT - AG规则)与剪接体(spliceosome)识别的特异性(specificity)的关联模型,建立其序列特征(sequence features)与剪接效率(splicing efficiency)的关联模型 🆔 ID: 161761 ✅ 可用

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建立剪接体(spliceosome)催化的剪接反应(splicing reaction)中,剪接体(spliceosome)各组分(components)(如U1、U2、U4/U6、U5 snRNP)的协同作用(synergistic action)与剪接效率(splicing efficiency)的关联模型,量化其协同参数(synergistic parameters)与剪接过程(splicing process)的关联参数 🆔 ID: 161762 ✅ 可用

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计算pre - mRNA中可变剪接(alternative splicing)产生的剪接异构体(splice isoforms)的稳定性(stability)与mRNA二级结构(secondary structure)和化学修饰(chemical modifications)的关联模型,量化其结构特征(structural features)和修饰特征(modification features)与异构体稳定性(isoform stability)的关联参数 🆔 ID: 161763 ✅ 可用

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模拟剪接体(spliceosome)对pre - mRNA的剪接过程(splicing process)中,细胞周期(cell cycle)阶段(phases)对剪接位点(splice sites)选择(selection)和剪接效率(splicing efficiency)的影响(impact),建立其细胞周期特征(cell cycle features)与剪接过程(splicing process)的关联模型 🆔 ID: 161764 ✅ 可用

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分析pre - mRNA的剪接位点(splice sites)的微环境(microenvironment)(如染色质状态chromatin state、核小体定位nucleosome positioning)对剪接体(spliceosome)识别(recognition)和剪接效率(splicing efficiency)的影响(impact),量化其微环境特征(microenvironment features)与剪接过程(splicing process)的关联参数 🆔 ID: 161765 ✅ 可用

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建立剪接异构体(splice isoforms)的表达调控(expression regulation)与转录因子(transcription factors)对pre - mRNA转录(transcription)和剪接过程(splicing process)的协同调控(synergistic regulation)的关联模型,量化其协同调控参数(synergistic regulation parameters)与异构体表达(isoform expression)的关联参数 🆔 ID: 161766 ✅ 可用

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