计算新冠病毒刺突蛋白（S蛋白）S1亚基与S2亚基之间的解离常数Kd（约为1 - 10nM），以及在受体结合域（RBD）与血管紧张素转换酶2（ACE2）结合过程中解离常数的变化（结合后Kd降低约10 - 100倍） 🆔 ID: 171966 ✅ 可用
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量化刺突蛋白在融合前构象（prefusion）和融合后构象（postfusion）之间转变时，S2亚基的七肽重复区1（HR1）和七肽重复区2（HR2）形成的六螺旋束（6 - HB）结构的稳定性（结合自由能约 - 30 - - 50kJ/mol） 🆔 ID: 171967 ✅ 可用
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建模刺突蛋白RBD与ACE2结合的动力学过程，结合速率常数kon约为103 - 10?M?1s?1，解离速率常数koff约为10?3 - 10??s?1，结合时间约10 - 100ms 🆔 ID: 171968 ✅ 可用
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追踪刺突蛋白在pH值变化（从pH7.4降至pH5.5）条件下的构象变化，S1亚基与S2亚基的解离速率增加约10 - 100倍，S2亚基的构象从融合前向融合后转变的速率加快约10 - 50倍 🆔 ID: 171969 ✅ 可用
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计算刺突蛋白S1亚基中受体结合基序（RBM）与ACE2相互作用的关键氨基酸残基（如Lys417、Gly446、Phe486、Glu484）的结合自由能贡献（每个残基约 - 1 - - 5kJ/mol） 🆔 ID: 171970 ✅ 可用
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量化刺突蛋白在免疫逃逸突变（如E484K、N501Y、K417N）发生后与ACE2结合亲和力的变化（结合亲和力变化约10 - 100%，结合常数Ka变化约103 - 10?M?1） 🆔 ID: 171971 ✅ 可用
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建模刺突蛋白在温度变化（从298K升至310K）条件下的构象动态，S1亚基的均方根波动（RMSF）增加约0.1 - 0.5?，RBD的构象灵活性增加约10 - 30% 🆔 ID: 171972 ✅ 可用
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追踪刺突蛋白在宿主细胞内吞过程中，与内体膜上低pH敏感蛋白（如NPC1）相互作用时构象的变化，S2亚基的HR1和HR2区域相互作用增强，形成6 - HB结构的速率加快约10 - 20倍 🆔 ID: 171973 ✅ 可用
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计算刺突蛋白在融合前构象下S2亚基的融合肽（FP）与细胞膜的相互作用能（约 - 10 - - 30kJ/mol），以及融合肽插入细胞膜的深度（约0.1 - 0.3nm） 🆔 ID: 171974 ✅ 可用
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量化刺突蛋白在疫苗接种后（如mRNA疫苗、灭活疫苗）诱导产生的中和抗体与RBD结合的阻断效率（阻断效率约30 - 90%），中和抗体与RBD的结合亲和力（Ka约10? - 10?M?1） 🆔 ID: 171975 ✅ 可用
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建模刺突蛋白在病毒进入宿主细胞过程中，与ACE2结合后触发的S1亚基解离和S2亚基构象转变的动力学过程，S1亚基解离时间约10 - 100ms，S2亚基构象转变时间约100 - 1000ms 🆔 ID: 171976 ✅ 可用
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追踪刺突蛋白在细胞培养液中（如DMEM培养基）不同离子浓度（如Na?、K?、Ca2?）条件下构象的稳定性，Ca2?离子浓度约1 - 10mM时，S1亚基与S2亚基的结合稳定性增加约10 - 30% 🆔 ID: 171977 ✅ 可用
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计算刺突蛋白在冷冻电镜（cryo - EM）结构解析中，融合前构象和融合后构象的分辨率（约2.0 - 3.5?），以及不同构象下原子坐标的均方根偏差（RMSD约0.1 - 0.5?） 🆔 ID: 171978 ✅ 可用
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量化刺突蛋白在病毒传播过程中（如气溶胶传播、接触传播），与宿主细胞表面ACE2结合的概率（约10 - 50%），结合持续时间约10 - 100ms 🆔 ID: 171979 ✅ 可用
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建模刺突蛋白在单克隆抗体（如REGN - COV2、LY - CoV016）作用下，RBD构象的锁定状态，抗体与RBD结合后RBD的构象变化受限，构象熵降低约10 - 30% 🆔 ID: 171980 ✅ 可用
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追踪刺突蛋白在病毒变异（如Delta变异株、Omicron变异株）过程中，RBD氨基酸序列的变化（如Delta变异株有L452R、T478K突变，Omicron变异株有多个突变位点）对与ACE2结合亲和力的影响（结合亲和力变化约10 - 100%） 🆔 ID: 171981 ✅ 可用
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计算刺突蛋白在融合前构象下S1亚基的C端结构域（CTD）与S2亚基的N端结构域（NTD）之间的相互作用能（约 - 5 - - 15kJ/mol），以及这种相互作用对维持融合前构象的贡献 🆔 ID: 171982 ✅ 可用
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量化刺突蛋白在细胞内质网（ER）和高尔基体（Golgi apparatus）加工过程中，糖基化修饰（如N - 连接糖基化）对构象稳定性的影响，糖基化位点（如Asn331、Asn343）的糖基化程度约10 - 50%，构象稳定性增加约10 - 30% 🆔 ID: 171983 ✅ 可用
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建模刺突蛋白在病毒与宿主细胞膜融合过程中，S2亚基的融合肽（FP）和跨膜区（TM）的协同作用，融合肽插入细胞膜后，跨膜区与细胞膜脂质双层的相互作用能（约 - 10 - - 30kJ/mol），促进膜融合的进行 🆔 ID: 171984 ✅ 可用
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追踪刺突蛋白在血清（如康复者血清、疫苗接种者血清）中不同中和抗体混合物作用下，RBD构象的综合调控效果，中和抗体混合物对RBD构象变化的抑制效率约30 - 90% 🆔 ID: 171985 ✅ 可用
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计算刺突蛋白在融合后构象下HR1和HR2形成的6 - HB结构中，每对螺旋之间的相互作用能（约 - 2 - - 8kJ/mol），以及整个6 - HB结构的稳定性对膜融合的贡献 🆔 ID: 171986 ✅ 可用
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量化刺突蛋白在病毒长期保存（如 - 80°C保存）条件下，构象的稳定性变化，保存1 - 12个月时，融合前构象的保持率约80 - 95%，RBD与ACE2结合亲和力的变化约10 - 30% 🆔 ID: 171987 ✅ 可用
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建模刺突蛋白在病毒通过呼吸道上皮细胞感染过程中，与细胞表面黏液层（如黏蛋白）相互作用时构象的适应性变化，黏液层对刺突蛋白与ACE2结合的阻碍作用约10 - 50%，刺突蛋白构象的调整使结合效率变化约10 - 30% 🆔 ID: 171988 ✅ 可用
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追踪刺突蛋白在病毒变异株（如Beta变异株、Gamma变异株）中，S1亚基和S2亚基之间的相互作用界面变化（如氨基酸残基替换）对S1亚基解离和S2亚基构象转变的影响，S1亚基解离速率变化约10 - 50%，S2亚基构象转变速率变化约10 - 30% 🆔 ID: 171989 ✅ 可用
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计算刺突蛋白在融合前构象下S1亚基的RBD与S2亚基的相互作用能（约 - 5 - - 15kJ/mol），以及这种相互作用对RBD构象灵活性和与ACE2结合能力的调控 🆔 ID: 171990 ✅ 可用
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量化刺突蛋白在病毒感染的早期阶段（如感染后1 - 6小时），与宿主细胞表面ACE2结合的初始速率（约103 - 10?个分子/秒），以及结合后触发细胞内信号通路的效率（约10 - 50%） 🆔 ID: 171991 ✅ 可用
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建模刺突蛋白在病毒与宿主细胞融合后，S2亚基的构象稳定在融合后状态，维持膜融合结构的时间约1 - 10分钟，期间对细胞内物质运输和病毒基因组释放的影响 🆔 ID: 171992 ✅ 可用
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追踪刺突蛋白在病毒传播过程中，与不同宿主细胞类型（如呼吸道上皮细胞、肺泡细胞、免疫细胞）表面ACE2表达水平（约103 - 10?个/细胞）和结合亲和力的关系，结合亲和力变化约10 - 100% 🆔 ID: 171993 ✅ 可用
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计算刺突蛋白在融合前构象下S1亚基的构象熵（约10 - 30J/(mol·K)），以及RBD与ACE2结合后构象熵的降低幅度（约10 - 30J/(mol·K)），对结合稳定性的贡献 🆔 ID: 171994 ✅ 可用
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量化刺突蛋白在病毒变异过程中，新出现的突变位点（如Omicron变异株的S371L、S373P、S375F突变）对RBD与ACE2结合界面静电相互作用（约 - 1 - - 5kJ/mol）和疏水相互作用（约 - 5 - - 15kJ/mol）的影响 🆔 ID: 171995 ✅ 可用
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