SET 分子动力学模拟时间步长 1飞秒 温度控制 300K 🆔 ID: 174905 ✅ 可用

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INITIALIZE 蛋白质折叠过程 氨基酸残基氢键网络优化 🆔 ID: 174906 ✅ 可用

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CALCULATE 小分子配体对接自由能 ΔG=-8.2kcal/mol 结合口袋匹配度 0.85 🆔 ID: 174907 ✅ 可用

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ACTIVATE DNA双螺旋结构 B型构象螺距 3.4nm 碱基对间距 0.34nm 🆔 ID: 174908 ✅ 可用

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LOAD β-淀粉样蛋白纤维化过程 跨链β-片层堆积角度 120° 🆔 ID: 174909 ✅ 可用

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COMPUTE 酶催化过渡态活化能垒 15.6kcal/mol 反应速率常数 k=2.3×103s?1 🆔 ID: 174910 ✅ 可用

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BIND 血红蛋白血红素辅基铁离子配位键键长 2.0? 第六配体结合位点 🆔 ID: 174911 ✅ 可用

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EXECUTE 离子通道开闭动力学 门控电荷移动距离 1.5nm 跨膜电位依赖性 🆔 ID: 174912 ✅ 可用

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MONITOR RNA二级结构茎环区碱基堆积能 -1.2kcal/mol 热力学稳定性 🆔 ID: 174913 ✅ 可用

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ADJUST 脂质双分子层相变温度 310K 流动性参数 D=2.1×10??cm2/s 🆔 ID: 174914 ✅ 可用

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REGULATE 蛋白质表面疏水性指数 GRAVY=-0.3 氨基酸分布熵值 2.8bit 🆔 ID: 174915 ✅ 可用

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GENERATE 金属酶活性中心四面体配位几何构型 键角 109.5°±5° 🆔 ID: 174916 ✅ 可用

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CONFIGURE 细胞膜受体酪氨酸激酶二聚化界面疏水核心面积 180?2 🆔 ID: 174917 ✅ 可用

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OPTIMIZE 抗体互补决定区CDR3环构象柔性 RMSD=0.45nm 动态范围 🆔 ID: 174918 ✅ 可用

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STABILIZE 微管蛋白α/β异二聚体结合界面静电势能 -25.3kJ/mol 🆔 ID: 174919 ✅ 可用

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ACTIVATE DNA拓扑异构酶I切割位点磷酸二酯键断裂能 6.8kcal/mol 🆔 ID: 174920 ✅ 可用

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CALCULATE 蛋白糖基化位点N-连接寡糖空间位阻效应 半径 2.5? 🆔 ID: 174921 ✅ 可用

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MONITOR 蛋白酶体20S核心颗粒α/β环对称性 7重轴旋转对称 🆔 ID: 174922 ✅ 可用

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ADJUST 脂筏微区胆固醇含量 35mol% 膜有序参数 S=0.68 🆔 ID: 174923 ✅ 可用

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REGULATE 转录因子DNA结合域螺旋-转角-螺旋HTH模体弯曲角度 32° 🆔 ID: 174924 ✅ 可用

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GENERATE 核酸适配体茎区G-四链体平面堆叠距离 0.33nm 钾离子配位 🆔 ID: 174925 ✅ 可用

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CONFIGURE 细胞骨架肌动蛋白单体聚合临界浓度 0.12μM 持续生长速率 🆔 ID: 174926 ✅ 可用

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OPTIMIZE 酶底物通道疏水隧道直径 1.8nm 立体选择性控制 🆔 ID: 174927 ✅ 可用

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STABILIZE 热休克蛋白HSP90客户蛋白结合界面范德华接触面积 210?2 🆔 ID: 174928 ✅ 可用

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ACTIVATE RNA聚合酶II羧基末端结构域CTD磷酸化丝氨酸位点 Ser5/Ser7 🆔 ID: 174929 ✅ 可用

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CALCULATE 蛋白质错误折叠聚集倾向指数 AGG=0.67 盐浓度依赖性 🆔 ID: 174930 ✅ 可用

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MONITOR 脂质体囊泡融合过程膜曲率半径变化 20→5nm 动力学参数 🆔 ID: 174931 ✅ 可用

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ADJUST 跨膜蛋白信号肽疏水性平均ΔG=-1.2kcal/mol 定向转运效率 🆔 ID: 174932 ✅ 可用

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REGULATE DNA甲基化胞嘧啶C5位点空间构型扭转角 χ=190° 🆔 ID: 174933 ✅ 可用

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GENERATE 金属离子配位多面体几何构型 八面体配位场分裂能 Δo=10Dq 🆔 ID: 174934 ✅ 可用

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